Odată ce a izbucnit Marele Război pentru Apărarea Patriei, a devenit clar un lucru: clopotnița „Sfântul Ioan cel Mare” și Catedrala Sfântului Vasile vor devenit punctele de referință pentru bombardierii germani. Era nevoie de o deghizare urgentă a construcțiilor Kremlinului de la Moscova, este vorba de o suprafață de 28 de ha acoperită de catedrale și clădiri.
La 22 iulie 1941 în Palatul Kremlinului a nimerit o bombă de 220 de kg. Spre mare noroc, aceasta nu a explodat.
Cum a fost deghizat Kremlinul:
–Turnurile și zidurile Kremlinului au fost revopsite și acoperite de ziduri de lemn pe care au fost desenate ferestrele;
– toate acoperișurile Kremlinului au fost vopsite cu culoarea maro de cărămidă, culoarea cu care erau vopsite majoritatea clădirilor din centrul Moscovei, deasupra grădinilor au întinsă prelata pe care au fost de asemenea desenate case și străzi.
– străzile pavate ale Kremlinului au fost acoperite de nisip;
– cupolele de aur ale bisericilor din Kremlin au fost vopsite și acoperite cu scânduri;
– deasupra Mausoleului a fost ridicată o machetă a unei clădiri urbane de lemn (corpul lui Lenin a fost evacuat în orașul Tiumen până în primăvara 1945);
– principalele clădiri din centrul orașului, precum Teatrul Bolșoi, au fost acoperite de fațade false și o plasă de deghizare.
În anii Marelui Război pentru Apărarea Patriei, Kremlinul de la Moscova a fost bombardat de opt ori: de 5 ori în anul 1941 și de 3 ori în anul 1942. Fasciștii au aruncat 15 bombe explozive, 2 obuze luminoase, 151 de proiectile incendiare și o bombă lichidă (un butoi de 200 de litri umplut cu petrol care nu a explodat).
A fost distrus parțial Arsenalul, au murit 60 de apărători ai Kremlinului. Cu toate că a lucrat în mod activ sistemul de apărare aeriană, în anii războiului aviația inamică a reușit să pătrundă în Moscova de mai multe ori. Raidurile au încetat abia vara anului 1942. În totalitate, în urma bombardamentelor au murit 2000 de persoane, au fost 6000 de răniți.